舰载单位的装载是海战策略的核心环节，涉及航母、运输机与海军基地的协同操作。航母作为海上航空力量的核心，其舰载机装载需通过空军基地完成，具体分为战斗机、轰炸机与侦察机三类。每类舰载机需单独编组并分配至航母甲板，且航母的舰载机容量受限于其等级与科技加成。装载过程中，需确保航母处于安全海域，避免敌方潜艇或空军干扰。运输机则用于快速部署陆军单位至前线，但需注意坦克类重型装备无法通过运输机空运。
舰载机的作战效能与装载顺序密切相关。优先装载战斗机可确保制空权，为后续轰炸机提供掩护；轰炸机则专注于对海面目标的远程打击；侦察机用于扩大视野范围，为舰队提供情报支持。舰载机出击后需考虑燃料与弹药补给，航母需定期返回友方港口或依靠补给舰完成资源补充。若航母被击沉，未起飞的舰载机将全部损失，因此需合理规划出击节奏与撤退路线。
海军基地是舰载单位装载的前置设施，需提前建造并升级。基地等级决定了可生产的舰船类型与装载效率，高阶基地还能解锁特殊舰载装备，如反潜直升机或预警机。陆军单位通过商业区运输至港口后，需手动点击装载指令进入运输船，运输船容量与船型相关。海军单位无法直接装载陆军，需通过中转基地或运输船实现海陆协同。
航母编队需配备驱逐舰护航以防范潜艇，同时巡洋舰提供防空掩护。运输船队则应避开交战区，选择隐蔽航线。所有舰载单位的装载状态可通过舰队管理界面实时监控，建议在非战斗状态下完成大规模装载调整，避免因操作延迟影响战局。
航母编队可通过快速部署舰载机改变局部制空权，而运输船队能实现跨战区兵力投送。玩家需根据战场态势动态调整装载优先级，例如在争夺关键岛屿时优先运送防空部队，或在对舰作战前集中装载反舰轰炸机。这种灵活性是海战取胜的关键因素之一。
